Wave Alpha được Boonsiew Honda phân phối tại Malaysia sở hữu thiết kế rất khác biệt so với phiên bản được bán tại nước ta. Xe sử dụng những đường nét thiết kế thể thao sắc sảo cùng kích thước tổng thể 1,937 mm x 709 mm x 1,090 mm, với chiều cao yên 768mm và khối lượng 98kg.
Không chỉ được bán tại Việt Nam, Honda Wave Alpha cũng được bán tại Malaysia tuy nhiên phiên bản tại Malaysia lại có nhiều khác biệt.
Thay vì sử dụng vành nan hoa, Wave Alpha tại Malaysia có cặp vành đúc được hoàn thiện thể thao hơn, với đường kính 17 inch. Đi kèm với đó là cặp lốp không săm có kích thước trước - sau lần lượt là 70/90 – 17M/C 38P và 80/90 – 17M/C 50P. Xe cũng được trang bị giảm xóc trước ống lồng và giảm xóc sau lò xo tạo sự ổn định khi vận hành.
Ngoài ra, Wave Alpha tại Malaysia cũng được trang bị phanh đĩa trước và tang trống sau đưa tới khả năng dừng xe an toàn hơn. Kèm theo đó cụm đồng hồ analog toàn phần, ổ khóa cơ truyền thống cùng cốp chứa đô 7,3 lít khá tiện lợi cho người sử dụng.
Sự khác biệt giữa Wave Alpha tại Malaysia và bản phân phối tại nước ta còn là ở động cơ. Cụ thể, Boonsiew đưa tới Wave Alpha của họ khối động cơ xy lanh đơn dung tích 109,2cc làm mát bằng không khí. Khối động cơ này sản sinh công suất tối đa là 6.5 kW / 7,500 rpm và mômen xoắn cực đại là 8.7 N.m / 5,500 rrpm. Ngoài ra, xe cũng được tích hợp phun xăng điện tử thay vì chế hòa khí như bản đang bán tại nước ta.
